Wie jede Bildungseinrichtung benötigt auch die AMSEL einen Träger, der die Rahmenbedingungen für einen verlässlichen Schulbetrieb schafft. Hierzu wurde im Juni 2018 der gemeinnützige Verein >AMSEL Schule e.V.< gegründet.

Zusammen mit dem Förderverein ist er die wichtigste Instanz der Schule, denn er stellt die Schulräumlichkeiten zur Verfügung, regelt die Personalangelegenheiten, ist zuständig für die Abschlüsse der Schulverträge mit den Eltern sowie für die Einhaltung geltender Gesetze und des pädagogischen Konzeptes.